Dal 1996 l'aeroporto di Treviso è parte del Sistema Aeroportuale di Venezia; Save S.p.A. la società che gestisce l'aeroporto Marco Polo di Venezia è infatti uno dei principali azionisti di Aer Tre (80%).
I due aeroporti distano tra loro 20 km e nella loro diversità, per tipo di struttura e di traffico, rappresentano un polo aeroportuale versatile.
L'aeroporto di Treviso, per caratteristiche geografiche, strutturali e operative, è dedicato a voli di tipo regionale, low-cost e charter. I due aeroporti sono pertanto complementari e costituiscono un Sistema Aeroportuale che si sviluppa in armonia, nell'ottica di una corretta specializzazione del traffico.